产品介绍
生命科(kē)學(xué)数据库(持续更新(xīn)中)
序号 | 数据库名称 | 描述 | 网址 |
1 | RCSB PDB | 提供了全球所有(yǒu)生物(wù)體(tǐ)中发现的生物(wù)大分(fēn)子(蛋白质、DNA和RNA)3D结构的免费数据库 | https://www.rcsb.org/ |
2 | ZINC | 一个免费的用(yòng)于虚拟筛选的商(shāng)用(yòng)化合物(wù)数据库 | https://zinc.docking.org/ |
3 | PubChem | 一个开放免费化學(xué)数据库,主要含有(yǒu)小(xiǎo)分(fēn)子,但也含有(yǒu)较大的分(fēn)子,如核苷酸,碳水化合物(wù),脂质,肽和化學(xué)修饰的大分(fēn)子 | https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ |
4 | UniPort | 一个蛋白质序列和注释数据的综合免费数据库 | https://www.uniprot.org/ |
5 | NCBI | 同Uniport齐名,一个蛋白质序列和注释数据的综合免费数据库 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
6 | AlphaFold DB | 提供对由Alphafold2预测的超过2亿个蛋白质结构的数据库。 | https://alphafold.com/ |
7 | STRING | 已知和预测的蛋白质 - 蛋白质相互作用(yòng)的免费数据库。 | https://www.string-db.org/ |
8 | DrugBank Online | 一个包含有(yǒu)关药物(wù)和药物(wù)靶标的信息免费访问数据库(商(shāng)业使用(yòng)需许可(kě)) | https://go.drugbank.com/ |
9 | BindingDB | 一个关注候选药物(wù)靶标的蛋白质与小(xiǎo)的药物(wù)样分(fēn)子配體(tǐ)的相互作用(yòng)的公共数据库 | https://www.bindingdb.org/rwd/bind/index.jsp |
10 | SMPDB | 一个专门用(yòng)于支持代謝(xiè)组學(xué),转录组學(xué),蛋白质组學(xué)和系统生物(wù)學(xué)中的途径阐明和途径发现的免费访问数据库(商(shāng)业使用(yòng)需许可(kě)) | https://smpdb.ca/ |
11 | SwissTargetPrediction | 根据小(xiǎo)分(fēn)子在二维和三维相似性来快速搜索来自人和大小(xiǎo)鼠的3000多(duō)个蛋白中最可(kě)能(néng)的靶标 | http://www.swisstargetprediction.ch/ |
12 | PharmMapper | 使用(yòng)药效团映射方法识别给定探针小(xiǎo)分(fēn)子(药物(wù),天然产物(wù)或其他(tā)新(xīn)发现的具有(yǒu)未识别结合靶标的化合物(wù))的潜在候选目标,该数据库从TargetBank,DrugBank,BindingDB和PDTD中的所有(yǒu)靶标中提取(华东理(lǐ)工大學(xué)开发,禁止商(shāng)业用(yòng)途) | http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/ |
13 | ScPDB | 从PDB数据库衍生而来,是PDB数据库中可(kě)药物(wù)结合位点的注释数据库,可(kě)為(wèi)药物(wù)设计提供帮助。 | http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr/scPDB/ |
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